El Municipio para su organización territorial y administrativa, está integrado por una Cabecera Municipal, Pueblos, Barrios, Rancherías, y un Caserío, divididos en Delegaciones y Subdelegaciones de acuerdo a la situación política y social en cada caso, que son los siguientes:
I. Cabecera Municipal: San Andrés Timilpan.
II. Pueblos:
1. Ignacio Zaragoza
2. Iturbide
3. Morelos
4. Palmito
5. Rincón de Bucio
6. Santiaguito Maxda.
7. San Antonio Yondejé
III. Barrios:
1. Hidalgo
2. Ocampo
IV. Rancherías:
1. Agua Bendita
2. Cañada de Lobos
3. Huapango
4. San Nicolás
V. Caserío:
1. Lomas de Emiliano Zapata
En el municipio de Timilpan y con base en el Art. 115 Constitucional que establece que: "Cada municipio será administrado por un ayuntamiento de elección popular directa y no habrá autoridad intermedia entre éste y el Gobierno del Estado..." existe un ayuntamiento elegido por el pueblo a través del voto; el cual tiene la siguiente estructura.
El Ayuntamiento de Timilpan está integrado por un Presidente, un Síndico, siete Regidores y la Secretaría del Ayuntamiento
Para el despacho de los asuntos de la Administración Pública municipal, el Presidente Municipal se auxilia de las siguientes dependencias:
I. Secretarías
a) Secretaría del Ayuntamiento
b) Secretaria Técnica
II. Tesorería Municipal
a) Área de Catastro y Predial
III. Contraloría Municipal
IV. De las Direcciones
a) Dirección de Obras Públicas y Desarrollo Urbano
b) Dirección de Desarrollo Económico
c) Dirección de Seguridad Pública
d) Dirección de Desarrollo Social
e) Dirección de Ecología y Medio Ambiente
f) Dirección de Desarrollo Agropecuario y Rural
g) Dirección de Casa de Cultura
h) Dirección de Servicios Públicos
i) Dirección del Instituto Para la Protección de los Derechos de las Mujeres
V. De las Coordinaciones
a) Coordinación de Protección Civil
b) Coordinación de Agua Potable
c) Coordinación de Limpia y Saneamiento
d) Coordinación de Alumbrado Público
e) Coordinación Municipal de Mejora Regulatoria
VI. De las Oficialías
a) Oficialía 01 del Registro Civil
VII. Juzgado Cívico
VIII. De los Órganos Descentralizados
a) DIF Municipal
1. Dirección del DIF Municipal
b) Instituto Municipal de Cultura Física y Deporte de Timilpan
IX. Órganos Autónomos
a) Defensoría Municipal de Derechos Humanos
Son autoridades auxiliares del municipio, delegados y subdelegados, jefes de sector o de sección y jefes de manzana. Los delegados y subdelegados, son elegidos por votación, duran en el cargo tres años.
Sus funciones son ejercer, en sus respectivas jurisdicciones, las atribuciones que les delegue el ayuntamiento, para mantener el orden, la tranquilidad, la paz social, la seguridad y la protección de los vecinos, conforme a lo establecido en los reglamentos respectivos.
El municipio pertenece al I distrito electoral federal con cabecera en Jilotepec y al XIV distrito electoral local con cabecera en Jilotepec.
